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分子对接结果怎样作图与分析呢？ - 知乎 其中，蛋白显示为cartoon模式，小分子显示为sticks模式。从图中可以看出，小分子很好地占据在蛋白的结合口袋内。 b 查看极性相互作用。在对象列表窗口选择小分子依次点击"A→find→polar contacts→to any atoms"，得到小分子与蛋白之间形成的氢键。