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英文字典中文字典相關資料:
- SMILES InChI | 化学结构的线性表示法 - 知乎
SMILES表示法、SMARTS表示法和InChI表示法都是用少量字符表示结构信息的重要方法。 化合物的图表示 可以将一个分子视为一个以原子为节点,结合为边的图。图形可以表示一个原子如何连接到另一个原子。如果已知原子…
- 有没有哪个软件可以查找各种物质的化学结构式? - 知乎
PubChem 检索可得到的结果包含了分子式、SMILES、2D和3D结构、InChI和InChIKey、相对分子质量、脂水分配系数、氢键受体和供体数目、可旋转键数目、互变异构体数目等基本的结构信息和物化性质,除此以外,还有该化合物作为药物的剂型和商品信息、药理性质、毒性
- 使用PubChem想搜索药物的SMILE只有药物名,能找到准确的化学结构吗? - 知乎
使用PubChem通过药物名搜索SMILES,通常可以找到准确的化学结构。 PubChem是一个非常全面的化学信息数据库,包含了大量的药物信息,包括药物名称、化学结构、SMILES、InChI等。
- 在线批量转化smile 到sdf: work smart - 知乎
这个脚本本身或者经过简单的修改可快速在线将众多smiles转化为对应的三纬结构,而无需在自己电脑安装任何软件。 在Colab或者本地Jupyter(或者百度AI)运行该脚本,将smiles每行一个粘贴到一个smi或者txt文件,使用还脚本可生成对应的三维分析结构,…
- 机器学习做MD模拟时,分子的特征描述符指的是什么,和分子描述符(如smiles)的关系是什么? - 知乎
在上面这个示例里,我们将SMILES字符串“CCO”转化为一个长度为1024的位串(分子指纹),可以直接用作机器学习模型的输入特征。 简单总结一下: 分子的特征描述符是分子描述符在机器学习模型中的具体表示形式,它们可以通过多种方法从分子描述符(像SMILES)中提取和处理,以便于模型训练和
- 有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同的两物质属于一个物质吗? - 知乎
有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同的两物质属于一个物质吗? 正在做网络药理学,在数据库中搜到的成分,smiles一样,但是pubchem中属于两个物质,比如pubchem CID 99516 和pubchem …
- 请问,如何将化合物名称批量转化为化学式? - 知乎
请问,如何将化合物名称批量转化为化学式? 各位大佬好,我在本草组鉴数据库下载下来的多个活性成分的名称,想将其批量转化为smiles格式的一维结构,请问该如何做呢? 非常感谢! 显示全部 关注者 5 被浏览
- 干货丨化合物靶标预测平台工具盘点 - 知乎
使用方法: ①打开 网站主页:swisstargetprediction ch ②在Select a species处选择物种,默认选择人; ③上传需要预测靶标的分子结构,可以以Smiles代码或在右侧窗口中画出结构; 当然也支持从文件中直接导入结构,如 sdf、 mol格式等;
- 请问这种有机物表示方法叫什么名字啊? - 知乎
这个是SMILES,要是想用这种分子描述方式来画结构式,给你提供一点思路。 1 直接复制进 chemdraw,自己会转化(相对的,手动操作,流程较长,不便于批量) 2 若要批量绘制,用 RDkit 的库,导入smi后转为mol绘图就可以了;或者转为mol后存成sdf,用openbable转成chemdraw能开的格式就行。 (rdkit是python的
- 求助网络药理学大神!? - 知乎
第二步: SwissADME 导入结构或者粘贴SMILES号,点击Run! 通过类药性五原则判断成分取舍。 第三步: SwissTargetPrediction 预测符合要求的成分靶点,输入SMILES号预测 2、DrugBank数据库预测常见成分靶点(西药) 需要注册 网络药理学问题欢迎评论、私聊!
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