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- PyMOL小白自留教程 - 知乎
PyMOL软件从安装到使用的全套教程。自从去年第一次更新《PyMOL小白自留教程——PyMOL的安装》以来,跟大家分享了PyMOL从安装到使用的一些方法,交流了很多在安装和使用中遇见的很多问题。
- 如何用Pymol做出那些美呆的结构图(基础篇) - 知乎
Pymol名字的来源:“Py”表示该软件基于 python 这个计算机语言,“Mol”则是英文分子(molucule)的缩写,表示该软件用来显示分子结构。当你打开Pymol后,你将会看到如下图所示的界面: 该界面分为2窗口,上面的外部GUI窗口(External GUI)和下面的
- Pymol怎么用? - 知乎
PyMOL是少数可以用在结构生物学领域的开放源代码视觉化工具。该软件以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的,“MOL”表示它是用于显示分子结构的软件。1 安装PyMOL 首先,登录官网,直接点击DOWNLOAD NOW,下载最
- pymol实战教程 - 知乎
pymol可以用于展示大分子结构,很多文章中绚丽的结构图都是pymol做的 pymol有商业收费版本和学术免费版本 也可以去咸鱼上花不超过5块钱购买 免费pymol需要有教育有限@edu的邮箱 然后 Registration For Educational-Use Only PyMOL Builds 去注册,完成后会把下载的链接…
- pymol安装以后打不开? - 知乎
pymol开源版按照描述操作安装完成后打不开,大概率是因为显卡的问题,可以在设备管理器中找到显示适配器,右键禁用除了NVIDIA以外的显卡,应该就可以打开了,最后别忘了用完pymol以后再启用禁用掉的显卡。
- 做分子对接用pymol可视化时,小分子化合物和蛋白质之间没 . . .
在 PyMOL 中进行分子对接并可视化时,如果小分子化合物和蛋白质之间没有显示氢键,可能是由以下几个原因造成的: 1 氢键参数设置不当:在 PyMOL 中,需要设置合适的参数来显示氢键。
- 使用PyMOL:当界面中有多个蛋白质分子时,如何移动其中 . . .
在PyMOL中,当你需要在一个场景中移动多个蛋白质分子中的某一个时,你可以按照以下步骤操作: 1 选择目标分子: - 首先,确保你已经加载了所有的分子结构到PyMOL中。 - 使用`select`命令来选择你想要移动的分子。例如,如果你的分子名为`protA`,则 ```
- 如何用Pymol做出那些美呆的结构图(晋级篇) - 知乎
Pymol是区分大小写的,不过目前为止Pymol还是只用小写,所以记住,所有的命令都是使用小写字母的。下面我们先来了解一下Pymol的语法。Pymol命令的语法 Pymol的命令都是由关键词(keyword)加上一些变量(argument)组成,格式如下: 无变量命令
- 想请教一下怎样使用chimera、discovery studio、pymol这三 . . .
该公司承担了 PyMOL 的开发、维护、支持和销售 • 2017 年,薛定谔对分发系统进行改造,统一了 Qt 下的用户界面和 Anaconda 下的包管理,并将其发布为 PyMol v2--PyMOL 命令行--除图形界面外,PyMOL还可以通过命令行操作,Python接口为使用者带来了
- 从AlphaFold数据库上下载的结构数据,用PyMol打开,怎么 . . .
通过遵循这些步骤,你应该能够在 PyMOL 中可视化并保留 AlphaFold 结构数据的置信度信息。 请注意,确保你的 AlphaFold 结构数据文件中包含 B 等值信息。 如果不包含,你可能需要联系 AlphaFold 数据库或转到其它资源获取带有置信度数据的结构文件。
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